南亚所的国际合作与交流始于1960年（原粤西试验站）。1978年，我国政府做出了改革开放的重大决策，在加大经济对外开放的同时，把加强国际科技合作当作国家科技事业发展的一项重要任务来抓。在此大环境下，我所的国际科技合作与交流开始恢复发展起来。截止到2000年，我所共派遣科技人员12人次出国学习、进修、考察等。同时邀请外国科学家、政府官员和爱国华侨等20人次来所考察、讲学和交流，并给我所带来了宝贵的芒果和澳洲坚果等种质资源。南亚所历年出国考察、执行科研任务和参加国际会议83人次，通过国家公派留学基金委资助出国访学和国外攻读博士学位等人员达6人次。

2000年至今，我所积极开展国际合作与交流，加大了国际科技合作力度，加强了对发展中国家的技术援助，国际合作单位逐年增加，合作人才队伍也逐渐增强。主要内容包括科研项目合作研究、学术交流、学术访问和科研人员进修等三个方面。在“走出去”方面，共计71人次分别赴澳大利亚、巴西、泰国、南非、肯尼亚等国家进行考察、执行科研任务和参加国际会议等。出国访学和攻读博士学位等人员6人次。在“请进来”方面，美国、澳大利亚、德国、法国、巴西等国外大学，科研机构、政府机构的专家和官员等87余人次来所作报告、访问和交流。获得国际合作项目立项8项，到位经费约381.5万元。与美国路易斯安那州立大学和佛罗里达大学签署了合作协议。

通过国际交流与合作，加深了我所与国外相关单位之间的了解，拓宽了我所对外交流合作的渠道和领域，搭建了新的合作平台。对提高我所的科研水平，扩大我所的对外影响，增加合作项目方面起到了极大的促进作用。另外也为我所的未来发展奠定了良好的基础。

1987年8月，法国果树与柑桔研究所专家马丁博士在粤西站考察芒果和澳洲坚果并作学术报告

2018年11月，开展土壤固碳与农田质量监测国际研讨会

面向未来，南亚所将坚持“求实办所，开放办所，特色办所”的发展理念，瞄准区域农业产业发展和科技需求，以南亚热带重要经济作物为主要研究对象，围绕种质资源与遗传育种、栽培与生理、采后贮运与保鲜、农业资源高效利用与环境生态等领域，开展基础、应用基础和共性、关键技术研究，培育作物优良品种，发展优质、高产、高效栽培技术，取得一批方向性、主导性、标志性的科研成果，强化技术集成、示范与推广，为南亚热带作物产业和热区农业发展提供支撑。完善现代科研院所管理机制，不断提供研究所的科技创新能力、学术影响力和服务社会经济发展能力，拓展国际合作领域，努力创建一流的国家南亚热带农业科技创新中心和一流的成果转化与服务基地、一流的国际交流与合作基地，引领南亚热带农业科技发展方向，推动热带农业产业升级，促进农业可持续发展。